國家高新技術企業由科技部、財政部、稅務總局組成的全國高新技術企業認定管理工作領導小組認定。
高新技術企業認定項目是國家科技部管理，下設省級科技委，市級科技局，企業需要申請高新技術企業認定，須準備高新技術企業認定材料，提交到縣市級科技局高新科辦公室，經科技局高新科審核并公示，公示期一般為5天左右，無疑義后方可制定，蓋章，并頒發高新技術企業認定證書，證書有效期為3年。
3年內需要定期提交高新技術企業年報等有效數據，方可繼續享受高新技術企業扶持與優惠政策。
企業也可撥打當地科技局電話，了解咨詢高新技術企業認定條件等相關事宜，獲得權威有效信息。
其主要職責為
(一)確定全國高新技術企業認定管理工作方向，審議高新技術企業認定管理工作報告;
(二)協調、解決認定及相關政策落實中的重大問題;
(三)裁決高新技術企業認定事項中的重大爭議，監督、檢查各地區認定工作;
(四)對高新技術企業認定工作出現重大問題的地區，提出整改意見。
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